Sumario: | Para expresar la magnitud de la identidad
genética (similaridad) o su complemento
(distancia) entre dos individuos caracterizados
molecularmente a través de marcadores del
tipo microsatélites (SSR), que son multilocusmultialélicos,
es necesario elegir una métrica
acorde con la naturaleza multivariada de los
datos. Comúnmente, las métricas de distancias
genéticas son diseñadas para expresar,
en un único número, la diferencia genética
entre dos poblaciones y son expresadas como
función de la frecuencia alélica poblacional.
Dichas métricas pueden también ser utilizadas
para calcular la distancia entre perfiles individuales,
pero las frecuencias alélicas no son
continuas en este caso. Alternativamente, se
pueden usar distancias geométricas obtenidas
como el complemento del índice de similaridad
para datos binarios que indican la presencia/
ausencia de cada alelo en un individuo. El
objetivo de este trabajo fue evaluar simultáneamente
el desempeño de ambos tipos de
métricas para ordenar y clasificar individuos en
una base de datos generadas a partir de loci
de marcadores microsatélites SSR. Se calcularon
11 métricas de distancias a partir de 17
loci SSR obtenidos desde 17 introducciones
de un banco de germoplasma de soja [Glycine
max (L.) Merr.]. Se evaluó el consenso de
los resultados obtenidos para la clasificación
de los 17 perfiles moleculares desde varias
métricas. Los resultados sugieren que los
diferentes tipos de métricas producen información
similar para comparar individuos. No
obstante, se realizó una clasificación de las
métricas que responden a diferencias entre
los núcleos de las expresiones de cálculo.
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